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Asconit Consultants et l’INRA de Thonon ont co-encadré une thèse CIFRE (2009-2012) intitulée « Apport des outils de la biologie moléculaire pour l’utilisation des diatomées comme bioindicateurs de la qualité des écosystèmes aquatiques lotiques et pour l’étude de leur taxonomie » et réalisée par Lenaig Kermarrec.

Les différents travaux de cette thèse ont conduit à la création d’une base de données «espèces » mettant en lien des séquences de diatomées avec leur identification morphologique. Depuis, les travaux se sont poursuivis au sein de l’ Unité CARRTEL de l’INRA de THONON et une base de données, nommée R-Syst::diatom, riche de plus de 5 000 spécimens et qui permet d’identifier les diatomées à partir de séquences moléculaires a récemment été publiée (http://138.102.89.20/new_rsyst_alg/). La technologie moléculaire initiée au cours de la thèse a été validée par une étude sur les cours d’eau menée à Mayotte (Kermarrec L., Franc A., Rimet F., Chaumeil P., Frigerio J.M., Humbert J.F. & Bouchez A., 2014. A next-generation sequencing approach to river biomonitoring using benthic diatoms. Freshwater Science, 33, 349-363.) et va maintenant être testée à l'échelle du territoire français.

 

Pour en savoir plus : http://presse.inra.fr/Ressources/Communiques-de-pr...